经期做阴超不会感染，经阴道的超声检查都会在这个探头上戴一次性的避孕套来防止感染，而且使用的耦合剂也都是消毒的耦合剂，避孕套一般都是一人一个，即使同一个病人重复的检查也会更换新的避孕套，并且操作的时候超声医生会使用一次性的手套，防止出现院内感染以及交叉感染。
因此并不一定说在经期做阴式超声就会出现感染的情况，但是对于正常的患者建议在月经干净2-3天再进行阴道的检查，因为这个时候子宫内膜是比较薄的，对于观察子宫内膜来说效果是最好的。