男性阴茎流脓、小便刺痛大多是两种情况引起：
1、淋病双球菌所引发的淋菌性尿道炎；
2、由普通的化脓杆菌感染引起的尿道炎，称为非特异性尿道炎，又称非淋。
它们的共同特点是尿道有异常的脓液流出，而且伴有尿道的刺痛，因为这些细菌都会破坏尿道的黏膜。对于这两种疾病的确诊，自我诊断的重点就是是否有冶游史，也就是不安全的性生活，要进行病史追踪。
往往在发病前的2-4天左右会有接触史，极少数人会有2周以上的接触史。还要去正规的三甲医院做化验，做淋球菌的检测、非淋球菌的检测，确诊以后再做下一步的治疗。
病人在这期间的自我管理主要就是完全禁止性生活一个月左右，每天都要换洗贴身的内衣、内裤，用开水烫洗，还要避免刺激性的食物，比如川菜、饮酒，还有大量的吸烟，这些都会加重尿道的刺激症状。