轻中度的农药中毒，如果得到及时的治疗，一般都没有后遗症。但是重度的中毒而且合并有并发症的，通常会引起多器官的功能损害，后遗症是比较严重的。如果是中枢神经系统的后遗症，通常会出现头晕、头痛、精神或注意力不集中、手脚不协调、失眠多梦、智力减退，严重的可能会出现长期的昏迷、植物生存状态。如果是肾功能的问题，会引起肾损害，还会导致长期的血尿、蛋白尿、全身浮肿、尿少等肾功能衰竭的表现。如果是肝功能损害后遗症，通常会有转氨酶持续的升高，出现黄疸、经常疲劳、乏力、食欲下降等后遗症。