新生儿肛门破皮的处理措施如下：
1、建议家长在宝宝大小便之后，用清水清洗臀部，用软毛巾吸干水分后晾五分钟左右，然后给臀部发红、破皮的部位涂抹蛋黄油，蛋黄油具有清热、润肤、消炎、止痛、收敛生肌和保护创面的作用。
2、可以在医生指导下给肛门破皮处，涂抹莫匹罗星软膏或者是红霉素软膏，以预防感染。
3、在肛门破皮处愈合之前，先不要使用尿不湿，可以使用尿布垫，要保持臀部的清洁、干燥，这样利于破皮处愈合。
4、建议家长要加强日常护理，在宝宝大小便之后要清洗尿布区域，并且及时更换尿布，能有效预防肛门破皮情况的发生。