肛门疼痛的原因一般有以下几个方面：
1、肛周的湿疹或肛周炎，主要是由于肛周汗液刺激、潮湿，以及肛周的清洁不及时，粪便的刺激引起肛周的皮炎或湿疹，从而引起疼痛的症状。
2、痔疮,，是肛周最常见的良性疾病，在痔核体积增大时，会由于大便导致其表面的黏膜磨损产生溃疡、炎症，从而产生疼痛和出血的症状。
3、肛裂，主要由于大便干结以及大便较粗，在解大便时使肛周的黏膜和皮肤发生撕裂，从而产生疼痛和出血的症状。
4、直肠息肉和直肠癌，体积较大时，由于其表面发生磨损或者溃疡从而产生炎症，引起疼痛和出血的症状。