发热咳嗽的时候所吃的药物分两部分，具体如下：一部分针对发热咳嗽进行对症治疗；另一部分是针对引起发热咳嗽的病因进行治疗。孩子引起发热的原因很多，像伴有发热咳嗽多数是呼吸道的感染，可以是上呼吸道感染、咽炎、扁桃体炎、喉炎，也可以是气管炎或者是支气管肺炎。不同的感染状态所进行的药物治疗会有很大的差异性，孩子如果是上呼吸道感染，如果是病毒性的不需要抗生素，只需要对症治疗，如果是细菌性的感染就需要使用抗生素。
如果是支原体感染，一般就需要大环内酯类的药物进行抗炎治疗，而且根据感染的程度，所使用药物的程度和疗程都会有差异。像同样的都是支原体感染，如果是在上呼吸道可以口服大环内酯类的药物，如果引起的是肺炎，必要的情况下，可以通过静脉给药，保证孩子的炎症控制之后，发热咳嗽症状就会缓解，这是针对孩子的病因进行处理，同时也要针对孩子的症状进行处理。像发热的时候可以给孩子服用一些退热的药物，超过38.5℃可以服用对乙酰氨基酚或者布洛芬都有比较良好的退热作用，孩子要根据咳嗽的情况，比方有些是有痰咳，有些是干咳，所使用的药物就会略有区别。孩子发热咳嗽使用的对症的药物是要根据具体的状态，不同的症状给予不同的药物。