儿童的乳牙如果出现根尖脓肿，应该尽早进行治疗，建议到正规医院的口腔科或者大型医院的儿童口腔科就诊。如果脓肿比较小，只位于根尖区，应该尽早进行开髓引流，将根尖区的脓汁通过牙齿引流到口腔中，可以使脓肿迅速缩小，不至于不断的刺激周围的牙槽骨，造成牙槽骨吸收。
如果已经形成了黏膜下的脓肿，应该迅速进行脓肿切开引流，直接将黏膜下的脓汁引流到口腔中，然后再钻开牙齿，治疗根尖周围的炎症，控制根尖脓肿，防止急性的根尖周炎症转变成慢性的炎症。如果是慢性的炎症就会形成根尖肉芽肿，还有可能变成根尖囊肿，如果形成根尖囊肿，囊肿不断扩大，就有可能影响后继的恒牙胚，造成恒牙阻生，所以如果出现儿童乳牙的根尖脓肿，应该尽早治疗。