克罗恩病的患者会并发肛周多发瘘管或者瘘口的形成，病人会有反复的肛周潮湿、瘙痒和排便带血，甚至也会诱发局部软组织的感染。如果形成明显的肛瘘，应该选择手术切除，术后抗炎治疗并且定期换药。
同时应该积极的治疗原发疾病，对于肠道的慢性炎症性疾病，应该注意饮食结构的调理和一般治疗。不能暴饮、暴食，不要吃辛辣的食物和刺激性的食品，养成合理进餐、按时排便的良好习惯。
另外在每次排便之后，应该积极的进行肛周的清洗和坐浴，能够改善病情。在发作的急性期配合抗感染治疗，如果出现明显的脱水，也需要静脉补充液体及营养支持。提示监测内环境指标的变化。