新型冠状病毒核酸的检测，现在国内大部分三甲医院都已经开展了检测项目，可以直接到医院去检测。如果有流行的地区，很多也可以在社区采取标本，然后把标本送到医院去检测，常用的标本是咽拭子、鼻咽拭子、痰液或者在医院行气管镜检查之后可以采取肺泡灌洗液。
一般情况下，在潜伏期和起病的初期，多数冠状病毒存在于上呼吸道，而在疾病的后期上呼吸道的病毒量会减少，而下呼吸道的病毒量相对会增多，所以在潜伏期和起病的初期可以通过鼻拭子或者咽拭子来进行检测。这两个方法相对来说，鼻咽拭子检测的阳性率更高一些。如果是咽拭子和鼻拭子两个方法来选择，首先选择鼻咽拭子。对于住院的患者可以通过痰液以及肺泡灌洗液来进行核酸的检测，尤其是在后期，阳性率会明显提高。