小儿慢性胰腺炎的发病原因分为以下几种：可有遗传性胰腺炎，再就是慢性钙化性胰腺炎。它是一种常见染色体隐性遗传性疾病，遗传性胰腺炎的基因定于7号染色体长臂上。再就是慢性梗阻性胰腺炎、胰腺分裂症。胰腺分裂症在总人群中的发病率占5%-15%，是胰腺炎最常见的畸形。由于背侧和腹侧胰腺始基不能融合,导致胰尾、胰体和部分胰头通过相对狭窄的副胰管引流，而不是通过主胰管引流。再就是出现腹部的外伤、特发性纤维化性胰腺炎，后者比较罕见。另外，可有腹痛或者梗阻性黄疸的情况。