应当明确引起腋窝疼痛的具体原因，男性主要是由于急性腋窝淋巴结炎，以及皮脂腺囊肿或者毛囊炎感染所造成，女性可能是副乳，应针对病因进行治疗，才能起到很好的效果。
急性淋巴结炎、毛囊炎，或者皮脂腺囊肿并感染的患者，选用敏感的抗菌药物进行治疗，通常选用针对革兰氏阳性球菌的抗菌药物，如青霉素类、头孢菌素类和大环内酯类。口服的药物有头孢氨苄、罗红霉素以及阿莫西林、克拉维酸钾，口服药物效果欠佳，应当静脉注射。
局部红肿明显时，考虑给予硫酸镁以及鱼石脂软膏等湿敷。形成脓肿需要及时地切开引流，清除化脓组织。用生理盐水、双氧水、碘伏冲洗干净，放置凡士林纱布进行引流。
副乳的患者在日常生活中保持舒畅的心情，避免进食高热量以及含有外源性激素的食物，疼痛明显时口服中成药逍遥丸、乳泰胶囊等。严重的患者反复疼痛，影响生活和学习，考虑局麻下手术切除。