包皮环切手术常常在局麻下进行，局部麻醉后，患者在手术过程中并不会感觉到明显的疼痛和不适，一般局麻药失效以后，患者会感觉到短暂的疼痛，伤口疼痛一般不会超过一个小时，因此多数患者能够耐受。
对于极少数疼痛较为敏感的患者，术后出现疼痛可以口服止痛药来对症治疗，通常包皮环切术采用阴茎背神经阻滞的方法进行局部麻醉，这种方法需要进行局部注射麻醉，一些患者会感觉到疼痛不适。
目前也可以采用利多卡因乳膏，局部涂抹的方法来进行麻醉，这种方法相对于局部注射，患者心理恐惧感会减少，因此手术过程较为舒适。
但是无论何种麻醉，在麻醉药失效后患者仍会感觉到有局部疼痛的情况，可以配合止痛药物来缓解，总体来说疼痛大多数人都可以耐受。