牙齿根部发黑的原因，一般考虑以下几点：
1、不良饮食习惯：长期吸烟，喝茶、咖啡、可乐等饮料，黑色素会沉积在牙根面，导致发黑，质地坚硬，表面光滑，可以去除。
2、不注意口腔卫生及清洁：食物残渣、软垢粘固在牙根面形成结石，会刺激牙龈肿胀、出血，导致牙龈退缩。
3、楔状缺损：使用银汞合金充填，释放的金属离子可以渗透进入周围牙体组织而造成染色。
4、食物残渣：会在细菌的分解下产生酸性物质，破坏牙骨质，形成龋洞，造成牙根发黑。
5、牙髓坏死：使牙体组织会逐渐变得黯黑，失去光泽。