阴茎根部出现小疙瘩，如果近期有不洁的性接触史，很有可能是感染了人乳头瘤状病毒引起的尖锐湿疣。需要前往正规医院的泌尿外科，通过激光、冷冻、电灼去除小疙瘩，然后做病理学的检查。
一旦明确是尖锐湿疣，还需要全身注射干扰素的针剂，通过提高自身的免疫能力，彻底地清除体内残留的病毒，达到完全治愈的目的。如果通过检查排除是由于尖锐湿疣引起的，小疙瘩很有可能只是局部的毛囊炎，或者是皮肤感染引起的。
在手术去除以后涂抹一些抗感染的药膏，比如红霉素软膏、夫西地酸软膏、百多邦软膏，对症治疗1-2周，就能够预防复发。