如果患有结膜炎，而且是正在疾病的活跃期，也就是还没有治好的时候进行眼部的手术，这种情况是不被允许的，也就是说要进行任何的眼部手术，一定不可以在患者有结膜炎发作的时候进行手术。因为结膜炎的主要致病因素就是感染性的因素，通常是指细菌性感染、病毒性感染、真菌性感染或者是其他类微生物的感染。
如果有感染性的因素存在的话，而且处于疾病的活动期，显而易见，在这个时候进行眼部的手术就会人为的通过手术的切口、手术的入路，把这些感染性的因素带入到眼睛的内部去，或者导致眼底更严重的感染性病变，因此，要求是做眼部的手术，尤其是内眼的手术，不可以有活动性的炎性病变存在。