对于胆系结石引起的腹部疼痛，首先大多合并存在革兰氏阴性杆菌所造成的感染。因此首先应当选择，针对革兰氏阴性杆菌敏感的抗菌药物。常用的有头孢菌素类和抗厌氧菌的药物，首先选择头孢哌酮舒巴坦，联合甲硝唑或者奥硝唑。其中头孢哌酮舒巴坦，在胆汁内的浓度可以达到80%-90%左右，是首选治疗胆系感染的药物。同时如果疼痛非常明显时，还可以考虑给予应用解痉药物，如654-2、间苯三酚等。另外，如果结石性胆囊炎或者结石性胆管炎，引起了急性胰腺炎，还应当及时针对胰腺炎进行处理，首选抑制胰酶外分泌的药物，如生长抑素、奥曲肽等。必要时还需要给予禁食胃肠减压，补充液体以及电解质，同时注意观察患者的腹部体征，如果出现疼痛逐渐加重、压痛、反跳痛、肌紧张等腹膜刺激征的症状，还需要及时手术进行处理。