手足口病住院的指证有：1.年龄小于三岁，因为引起手足口病的病毒容易侵犯脑神经，年龄小的儿童机体抵御病邪的能力差，更容易发生脑干脑炎等危及生命；2.高热不退，经过积极抗病毒治疗72小时，体温仍反复不易降，这种情况也有发生重症手足口的可能，建议住院治疗；3.发病期间出现肢体抖动、寒战，不排除病毒引起毒血症的可能，也建议及时就诊。