割包皮的坏处主要是手术会引起疼痛、不适的感觉，术后可能会发生包皮切口创面感染，以及出血、裂开等相关并发症。一般可通过术后换药、消毒以及复查，来避免并发症发生。
割包皮的好处较为明显，由于割包皮主要是针对包皮过长、包茎，导致尿液以及龟头分泌物、尿道分泌物不能有效进行清洗，从而产生龟头炎、冠状沟炎症，乃至引起溃疡、糜烂，甚至会导致龟头癌、阴茎癌发生。因此，只有通过割包皮的方式才能使其缓解，从而避免相关疾病发生。