大部分先天性心脏病患者术后和正常人一样，在生活质量和预期寿命上没有特殊的差异，最为常见的先天性心脏病主要有卵圆孔未闭、房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭。发现得早，在孔洞发育不大的时候就做手术处理和干预，对寿命和预期没有任何影响，只要每年定期复查心脏B超、心电图，了解封堵器的位置、有没有侧漏就可以了。
如果已经出现了比较严重的并发症，比如右向左分流、艾森曼格综合征，这些不能通过内科治疗，或者是它的孔洞不适合内科介入处理，需要开胸手术的患者，这类的情况可能会遗留一些心功能不全、早搏、心律失常、胸闷气短的情况。
因此对于大部分的房缺、室缺、动脉导管未闭，术后和正常人一样，只有一小部分人错过了最佳手术时间，这有一定的影响；另外一些大的先天性心脏病，比如先天性法洛四联症或者是大动脉骑跨之类的情况，即便手术后可能仍然有一些不适，比如胸闷、气短，因此要定期随诊观察。此外还有主动脉瓣二叶瓣化畸形等一些瓣膜的问题都需要进行开胸手术，术后可能还要服用一定的药物进行处置，这对生活质量有一定的影响。