器质性疾病主要是由于某种或多种原因，导致人体内某一器官或某一组织系统产生病理性改变，进而造成功能减退或丧失，基本上属于永久性伤害是不可逆的。在生活中比较常见的器质性疾病主要有心脏病，例如先天性心脏病、心脏瓣膜病、心肌病等，除此之外还有胃溃疡、肺炎、炎症性肠病、胆囊炎、胆囊息肉、胆管炎等都属于器质性的疾病。
虽然器质性疾病通常会导致人体内某器官功能无法正常运转，但和功能性疾病还是存在一定差距的。功能性疾病一般是指人体内的某一器官本身并没有什么问题，只是出现功能失调，通过相应的治疗可以使其恢复正常工作，例如心脏神经官能症、轻微的心律失常等都属于功能性疾病。