肿瘤外科和肿瘤内科最大的区别是开刀和不开刀。肿瘤外科主要是指能够进行各种手术，将肿瘤切除解决问题的学科，这个学科是按部位来划分，在大型综合医院中没有专门的肿瘤外科，像胃癌专门胃肠肿瘤外科，乳腺肿瘤就是甲乳外科，这些都可以包含在肿瘤外科中。
肿瘤内科是除了开刀以外的治疗手段，包括放疗、化疗、靶向治疗、免疫治疗等，是应用各种不用开刀的设备以及药物来治疗肿瘤。还有一些在内科和外科之间相对过渡性的学科，比如肿瘤介入科，它也是有创性的治疗，但手术创伤很小，而且主要是通过介入的微创小手术进行治疗。