透明的痰液最常见的疾病是呼吸系统的疾病，比方感冒、咽炎、急性气管支气管炎、肺部感染、慢阻肺急性加重、支气管扩张并感染，都可以出现透明的痰液。心衰的时候，尤其是慢性心衰急性加重也可以出现透明的痰液。如果是呼吸系统感染性的疾病，要区分是病毒、细菌，还是支原体、衣原体等不同的病原微生物感染所引起。
如果是病毒感染所引起，可以给予抗病毒治疗，或者中医中药辨证治疗。如果是细菌感染所引起，一般可给予抗生素抗感染治疗，常用的有青霉素类的阿莫西林，头孢菌素类的头孢呋辛、头孢克洛等，或者是大环内酯类的阿奇霉素。如果是大于18岁以上的成人，也可以选用喹诺酮类的抗生素，如莫西沙星、甲磺酸左氧氟沙星等。如果是支原体、衣原体等病原微生物所引起，一般选用喹诺酮类的抗生素，或者大环内酯类的抗生素进行抗感染治疗。如果是心衰引起来的咳嗽，咳透明的痰液，一般抗心衰治疗就可以。