HPV检测阴性，如果合并有宫颈的细胞学检查，有可疑的一些异常的情况，也需要行阴道镜活检。由于有一部分宫颈癌并不是由于人乳头瘤病毒感染所导致，对于这一部分宫颈癌，HPV检测示阴性，但是宫颈细胞学检查有阳性的可能。此时仍然需要行宫颈活检，在进行活检的同时，还需要行宫颈管的搔刮，来排除宫颈管内的病变。
所以对于阴道镜检查活检来说，是否需要进一步的诊治，不是单纯依靠HPV这一项检测。如果高危型HPV-16和HPV-18阳性，不管TCT检查结果是阴性还是阳性，均需要行阴道镜活检。对于HPV阴性，但是细胞学检查有可疑阳性，或者发现一些异常的细胞，也需要行阴道镜活检，来进一步排除宫颈的病变，避免漏诊一些比较严重的疾病。