在临床上一般可疑接触了肺结核，或者可能会接触肺结核的患者，可以选择预防性的用药防止感染结核分枝杆菌，在临床上预防肺结核的药物主要是异烟肼和利福平。
此外，对于预防肺结核还有疫苗，一般是在新生儿出生的第一天就接种卡介苗，在一定程度上能够预防大部分肺结核的感染。即便是接种卡介苗疫苗以后感染了肺结核，也属于相对轻度的肺结核，比如不会发生结核性脑膜炎等。