磁共振在腹部与CT检查有相同之处，范围都分为上腹部、下腹部和盆腔，包括肝脏、胆系、胰腺、脾脏、胃肠、肾上腺、肾脏、泌尿系、膀胱。女性有子宫附件，男性还有前列腺、精囊腺等诸多器官，可以判断器官的形态、外伤损伤出血、炎症水肿，还有血管的情况。
磁共振不像CT可以探查密度。磁共振主要是了解信号，可以判断肿瘤侵犯的范围、，与周围组织结构的关系，了解原发肿瘤的形态学变化及其扩散转移侵润范围，确定肿瘤的分期，为治疗方案的定制提供客观的依据。
随访观察疾病的动态变化、疗效及复发情况，对手术后的并发症，如新鲜的出血、血肿与陈旧性的血肿的鉴别，还有脓肿的鉴别等，磁共振优于其他的方法。