如果发现肛门有痣，具体的治疗方式要根据不同的情况采取不同的治疗方式。如果是比较大的色素，沉着比较严重的痣，可以考虑手术治疗，一般超过1cm的痣建议还是手术治疗。
如果比较小的痣，而且色素沉着不是特别明显，可以考虑保守治疗，定期观察，必要时可以采取激光治疗的办法。
如果定期观察发现局部的痣有增大的趋势或有明显颜色加深的情况，也需要及时的手术治疗、激光治疗。如果发现肛门有痔，建议到正规的专科医院完善相关检查，明确诊断后，给予及时有效的对症治疗。