CT与核磁共振相比，CT的辐射更大一些。因为CT主要是利用放射线对人体进行断层成像，所以会对人体有一定的辐射。不同CT仪器检查的部位不同，检查的方式不同，对人体的辐射也就不同。一般增强CT要比普通的CT平扫辐射要更大一些，而核磁共振主要是利用外加磁场，对人体进行扫查。
所以不同于放射线类的检查方式，不会对人体产生明显的辐射，是一种相对安全的检查方式，所以更适合对放射线比较敏感的人群，比如婴幼儿或者是育龄期的女性，但是不能够单凭辐射量的大小来决定患者使用哪一种检查方式。因为不同的影像学检查适合于不同的疾病，必须要由医生根据患者的病情来决定。