尿液当中非鳞状上皮细胞增高有可能是慢性肾盂肾炎引起的，也有可能是慢性膀胱黏膜炎症引起的，需要通过进一步检查，包括尿培养、膀胱镜检查、泌尿系统CT检查明确诊断。
如果是慢性肾盂肾炎可以选择敏感的抗生素，比如呋喃妥因片、磺胺嘧啶片持续口服治疗2-4周，控制好慢性肾盂肾炎以后，尿液当中的非鳞状上皮细胞就会慢慢减少。
如果通过检查明确是存在慢性膀胱黏膜炎症，目前都是通过经尿道膀胱黏膜电切手术把病变黏膜切除掉以后，尿液当中非鳞状上皮细胞也会慢慢减少。
在治疗期间也可以同时口服一些清热利湿的中成药，比如三金片、热淋清胶囊、八正胶囊也有很好的效果。