病毒性心肌炎能否治好要取决于病因、临床表现，以及开始治疗时疾病所处的阶段。约有一半病例在经过积极的治疗后在2-4周都可好转，患者可以不留任何症状或不适，约有1/4的患者可以发展成为持续性的心功能不全。
有少数的患者病情恶化而死亡，或者进展为扩张型心肌病，最终需要心脏移植。如果在心肌炎急性期，出现严重的并发症，比如心力衰竭、心律失常或者心源性休克，则可导致患者死亡。