如果患有肾积水，建议去正规综合性医院泌尿科就诊，需要完善相关化验检查，明确梗阻的原因、部位等。应当根据梗阻的病因、发病缓急、肾功能损害的情况进行综合治疗。如果肾积水是尿路梗阻所引起的，根本治疗措施是去除病因，肾功能损害得以恢复。
治疗方法取决于梗阻部位的性质，如先天性肾盂输尿管连接处狭窄，应当切除狭窄段，并做肾盂成形术。如果是肾结石输尿管结石引起的肾积水，可以考虑行体外冲击波碎石术或经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石术。
如果病人病情危重，不允许做较大手术或梗阻部位暂时不能去除时，可以在超声引导下经皮穿刺肾造瘘术，使尿液直接引流出来，从而利于感染的控制和肾功能的恢复。待病人条件允许时，再行梗阻的病因治疗。如果梗阻病因不能去除，肾造瘘可以作为永久性的治疗措施。
对于一些难以修复的炎性狭窄或晚期肿瘤，引起的压迫症状导致的肾积水，可以经膀胱镜放置双J管植入术，引流尿液。