甲亢药物的副作用主要包括以下几点：一、白细胞减少或者粒细胞缺乏症，这是甲亢药物最为严重的一种副反应，也是比较常见的一项副反应。如果粒细胞缺乏比较严重，患者有可能出现非常难以控制的感染，所以甲亢患者在服用药物期间一定要定期监测血常规。二、甲亢药物会让一部分患者出现肝功能异常，尤其是对于长期服用丙硫氧嘧啶的患者，需要定期监测肝脏功能，有的患者甚至会出现爆发性肝功能异常或者肝衰竭。三、甲亢的药物长期服用过量，有可能会导致药物性甲减。以上是甲亢药物最常见的三项副作用。