阴蒂发黑的原因，一般与激素分泌相关，也与性生活相关。
阴蒂一般在青春期过后，进入性成熟期以后开始逐渐颜色发黑，因为性成熟期卵巢开始分泌雌孕激素，雌孕激素有促进外阴以及阴蒂部位黑色素沉积的作用，会导致阴蒂部位发黑，一般绝经之后外阴以及阴蒂部位颜色会逐渐变浅。
阴蒂发黑也与性生活过于频繁相关，性生活通过挤压、摩擦，有时会使局部皮肤黑色素分泌增多，表现为外阴或者阴蒂部位发黑。