抗原是针对身体免疫系统而言，如果没有抗原，免疫系统就无从识别外来的这些病原微生物，从而就没法产生抗体。所以从这方面来说，抗原是好的。大多数病原微生物感染人，只会是隐性感染的状态，或者症状比较轻微。这样的感染能够让自己的免疫系统提升免疫能力，这时的抗原也是好的。但当这些抗原来自于致病性特别强的病原微生物的时候，很可能让身体造成特别严重的损害，严重的甚至可以感染导致死亡，这时这些抗原来自的这些病原微生物就是坏的。但抗原能够让身体的免疫系统产生相应的抗体，如果把这些抗原提取出来制成疫苗，很可能能够提前让身体获得免疫能力。抗原所来自的病原微生物虽然是坏的，但这些抗原可以认为是好的。还有一种情况是自身免疫性疾病，这时免疫系统会将自身细胞的成分当成抗原。针对这些抗原所来自的细胞来说，并没有什么坏处，但是这时出现异常的是自己的免疫系统，这时候坏的就不是抗原，而是自己免疫系统将不该成为抗原的东西，当成了抗原来进行攻击。