通常情况下，肿瘤标志物的检测往往是通过采血的方式进行，在病人早上空腹的时候可以进行采血，送化验室检查血液中肿瘤标志物的含量。有的时候也可以将胸水或者腹水引流出来，送肿瘤标志物的检查，胸水、腹水中的肿瘤标志物含量指标的变化可以和病人血中肿瘤标志物指标的变化进行对比，从而加强对疾病的监测和诊断。
在不同医院的检验科实验室当中，进行肿瘤标志物检测的方法也有一定区别。有的医院采用的是酶联免疫方法进行肿瘤标志物的检测，而在另一些医院当中可能采用放射免疫的方法进行肿瘤标志物的检测。