土霉素是一种四环素类的抗生素，对于多种非典型病原体都有比较好的杀灭作用，例如立克次体、支原体、衣原体等，因此土霉素临床上可以用于治疗多种非典型病原体感染导致的疾病，例如立克次体感染导致的斑疹伤寒、恙虫病和Q热，支原体、衣原体感染导致的性病、淋巴肉芽肿或者非淋菌性尿道炎以及鹦鹉热、宫颈炎等。
另外，还可以治疗回归热、布鲁菌病，霍乱、鼠疫这些传染病也都是可以通过土霉素进行治疗。要注意土霉素在使用的时候应空腹口服，避免食物对药物吸收的影响，在服用本品期间要饮用足量的水以避免引起胃肠道黏膜的损伤，减少胃肠道的刺激症状。