酒精和碘伏，相对来说碘伏消毒的效果要更好一些。酒精的主要成分是75%的乙醇，主要用于完整皮肤表面的消毒，能够杀灭细菌、真菌，包括芽孢。碘伏的主要成分是络合碘，浓度在1%左右，也能够消灭细菌、真菌，包括芽孢等。
但是酒精具有刺激性，不可以用在伤口表面、伤口内部、口腔黏膜等地方。碘伏没有刺激性，相对来说应用非常广泛。它可以用于手术之前切口的消毒，也可以用于术后伤口表面的消毒、伤口内部的消毒，甚至口腔内部黏膜处都可以用它消毒，并且碘伏消毒完后不需要脱碘，也不会导致色素沉着。