医用硼酸主要的作用是消毒和防腐，经常配制成3%的硼酸溶液或者是软膏等剂型。硼酸溶液一般用于急性皮炎湿疹伴有糜烂、渗出的情况，用3%的硼酸溶液将4-6层纱布浸湿之后，潮乎乎的敷于皮疹处，具有消肿、利湿、抗炎等作用。
硼酸软膏也可以用于急性、亚急性湿疹，其具有抗炎、保护、收敛的作用。硼酸溶液临床上比较安全，但个别情况也会有刺激引起局部皮肤发红、瘙痒等表现。硼酸溶液一般用于大于3岁以上的儿童，婴幼儿应避免使用。