肛门有黏液流出，首先考虑肛门周围病变，如肛门湿疹，会引起肛门周围皮肤瘙痒、潮湿、有分泌物。这种情况建议患者肛门使用复方炉甘石洗剂进行清洗，可以使用止痒脱敏的药膏，或口服氯雷他定、盐酸西替利嗪等抗过敏药物缓解瘙痒、潮湿症状，减少分泌物溢出。
此外，痔疮、肛窦炎、肛瘘也会在肛门流出黏液，这些患者需针对原发性疾病进行治疗，可以通过保守治疗缓解症状，如肛门区温水坐浴，使用痔疮栓或痔疮膏外用，伴有炎症时使用红霉素软膏、派瑞松软膏消炎消肿，都可以减轻肛门黏液性分泌物流出。如病变较重，保守治疗效果不理想，则需行手术治疗。