尿路感染最常见的细菌是革兰氏阴性杆菌，大肠杆菌绝对最为常见。除此之外，还有金黄色葡萄球菌、变形杆菌，这是在尿路感染内排在前三位的细菌。当然，每家医院或者说不同区域，常见的致病菌都会略微有些不同，但是大肠杆菌肯定排在第一位。其感染的原因，比如女性的尿道外口毗邻阴道，所以这周围的像大肠杆菌之类，容易沿着尿道外口入侵。男性很多的时候是由于包皮过长、包茎，包皮垢里的细菌，大肠杆菌也很多，沿着尿道外口入侵导致尿道的黏膜充血、水肿、糜烂、溃疡，表面感觉神经外露，这在男女的尿路感染发病机理都差不多。
针对常见的细菌可能是革兰氏阴性杆菌，所以在治疗上首选喹诺酮类抗生素，比如左氧氟沙星。因为喹诺酮类抗生素，对大肠杆菌等常见泌尿系统致病菌有很好的覆盖，另外本身毒副作用较低，因此近20年来一直都是尿路感染的首选抗生素。当然，可以依据祖国医学解热通淋的治法，在治疗期间给予患者癃清片、八正胶囊这样的中成药辅助治疗，对于控制尿频、尿急、尿痛症状都有很好的帮助。