肛周肿大伴有疼痛的原因有痔疮、直肠脱出、肛周脓肿，具体如下：
1、痔疮：最常见，症状较轻时可多进食蔬菜、水果，增加纤维性食物，保持大便通畅防止便秘。同时便后注意清洁肛周卫生，可热水坐浴改善局部血液循环，还可以在肛周涂抹消炎、止痛药膏或治疗痔疮的药膏，如马应龙痔疮膏或肛泰痔疮膏，均可以有效缓解症状。若症状较重上述方法不能缓解，需要进行注射硬化剂使脱出的痔疮萎缩，或手术切除痔疮；
2、直肠脱出：脱出的痔疮发生感染或血栓，导致肛周肿大伴疼痛，建议局部外敷消炎、止痛的药膏，坚持热水坐浴，会有所缓解，若症状较重建议手术切除脱出的直肠；
3、肛周脓肿：需要服用抗生素，对脓肿较大者还需要引流脓液。