肛瘘是肛周脓肿破溃，或切开后的后遗症，肛瘘以肛周反复发作的流脓，及肿痛为主要临床表现。
肛瘘平时如果没有急性发作时，不需要使用任何药膏，如果出现急性发作，说明肛瘘局部有感染，可以使用百多邦、金霉素眼膏、红霉素软膏等，抗菌的药膏控制感染，也可用高锰酸钾按质量1:5000的比例进行配比坐浴，起到消炎的作用，这些都是对症治疗，治标不治本。
肛瘘如果要根治解决，需要进行手术治疗，肛瘘也只有通过手术才可能完全治愈