癫痫的病因是复杂的，有些癫痫根本找不到原因，这种癫痫在临床上称为原发性癫痫，也称为特发性癫痫，但目前对这种癫痫多认为可能由遗传基因突变或者某些先天性因素所致。
有些癫痫可以找到明确的病因，称为继发性癫痫或症状性癫痫，这种癫痫的病因有脑皮质发育障碍、脑瘤、头部外伤、中枢神经系统感染、脑血管病、脑寄生虫病、遗传代谢性疾病、神经系统变性疾病、脑病、系统性红斑狼疮、低钙和糖尿病等。
还有一种癫痫，根据症状已知为继发性癫痫，但是尚找不到明确的病因，临床上称为隐源性癫痫。