土霉素是一种四环素类抗生素，用药后患者可能会出现以下副作用。土霉素有可能引起消化系统的不适症状，如恶心、呕吐、上腹不适、腹胀、腹泻，偶然会出现胰腺炎、食管炎和食管溃疡的报道。土霉素还会引起肝毒性，通常为脂肪肝变性。土霉素还会引起过敏反应，多为斑丘疹和红斑，此外还可能会出现荨麻疹、血管神经性水肿、过敏性紫癜、心包炎以及系统性红斑狼疮加重，表皮剥脱性皮炎并不常见。
偶然也会出现过敏性休克和哮喘发生，并能够增加对日光的敏感性，用药时不要将皮肤直接暴露于阳光下。土霉素还会引起血液系统的副作用，偶然会引起溶血性贫血、血小板减少、中性粒细胞减少和嗜酸粒细胞减少。土霉素还会引起中枢神经系统副作用，偶然可能会导致颅内压增高，可表现为头痛、呕吐、、视神经乳头水肿等。土霉素还有可能会引起肾毒性，原有显著肾功能损害的患者，可能会发生氮质血症，加重高磷酸血症和酸中毒。
土霉素还有可能引起二重感染，长期应用可能会发生耐药金黄色葡萄球菌、革兰阴性杆菌和真菌等消化道、呼吸道和尿路感染，严重者可发生败血症。土霉素还有可能会沉积在牙齿和骨骼中，致牙齿产生不同程度的变色、黄染，牙釉质发育不良以及龋齿，并可导致骨骼发育不良。土霉素还可使人体内正常菌群减少，导致维生素B缺乏，真菌繁殖，出现口干、咽痛、口角炎和舌炎等。