如果12岁儿童出现头疼，主要是以下几种病因：
1、神经性头痛，如果儿童经常睡眠不足，平时学习过度劳累、过度用脑或者平时情绪过于激动等，都可能引发头痛症状，这种疼痛一般属于神经性的疼痛；所以儿童应该早睡早起，最好不要熬夜；如果病情严重，需要及时到医院诊治；
2、上呼吸道感染，要看儿童最近是否有发烧、感冒的迹象，因为感冒的主要症状是出现头痛或者浑身无力等；针对感冒可以用感冒药治疗，而且平时应当注意保暖、避免着凉；
3、鼻窦炎也是引发头疼的主要原因之一；
4、脑部疾患，比如由于脑膜炎、脑炎、脑瘤等引发头痛，此类儿童头痛较剧烈，建议患者及时到医院进行检查，明确诊断后进一步治疗。