心肌炎根据病变范围、感染病毒类型和机体的状态，临床的表现差异很大，患者的预后差异也非常的大。对于一些轻症的患者，也叫轻症自限型的患者，感染病毒感染1-3周之后，会出现轻度的心前区的不适、心悸，没有心脏的扩大，也没有心衰的表现，患者经过适当的休息治疗之后，可以完全的恢复。
但是对于一些急性重症型的也叫爆发性的心肌炎，愈后可能就会比较差。患者除了出现胸疼、心悸、气短症状之外，也会伴有一些心动过速、心衰或者是心源性休克，往往在数日之内就因为心脏衰竭或者严重的心律失常死亡。也有一种类型叫猝死型，患者从发病还没有来得及确诊，就于运动的时候猝死，死前没有明显的心脏的表现，在尸检的时候才被证实是急性的病毒性的心肌炎。
还有一部分叫隐匿进展型的心肌炎，病人病毒感染之后，有一过性的心肌炎表现。之后会出现心脏的逐渐扩大，表现为扩张性心肌病，会表现为一个慢性心衰的过程。如果治疗得当的话，寿命会受影响，但是整体预后相对还算不错。