杆菌指的是外观呈杆状的细菌，有一些杆菌是可以导致人体损伤产生疾病的，比如我们非常熟悉的痢疾杆菌可以导致痢疾，鼠疫杆菌可以导致鼠疫，伤寒杆菌可以导致伤寒，白喉棒状杆菌可以导致白喉，结核分枝杆菌可以导致结核。
但是也有一些杆菌是对人体有益的，是机体肠道的益生菌，比如有一些种类的大肠杆菌，比如一些乳酸杆菌。在临床上遇到杆菌感染时，要根据杆菌具体的种类来制定相应的治疗措施，也不能一概而论。