临床上，男性肿瘤标志物12项主要包括癌胚抗原、甲胎蛋白、糖类抗原19-9、糖类抗原125、肿瘤抗原15-3、癌抗原50、糖类抗原242、β2-微球蛋白、血清铁蛋白、神经元特异性烯醇化酶、人绒毛膜促性腺激素、肿瘤坏死因子，以上12项为肿瘤的标志物，男性中常见含还有EB病毒以及前列腺抗体。
临床上，由于不同的肿瘤体标志物不一样，所以可以分析一下，比如甲胎蛋白主要是来自肝脏，胚胎时期才会有，一般出生两周后甲胎蛋白就从血液中消失。如果患有肝癌，甲胎蛋白会明显升高。还有就是糖类抗原19-9常见于胆管细胞癌和胰腺癌，而糖类抗原125常见于卵巢癌，肿瘤抗原15-3主要见于乳腺癌，糖类抗原242主要见于胃癌、肠癌，血清铁蛋白主要见于胃癌，而神经元特异性烯醇化酶主要见于肺癌，肿瘤坏死因子可以见于多种肿瘤，癌胚抗原也是见于多种肿瘤，所以单单依靠肿瘤标志物来确诊恶性肿瘤不够，需要进一步的临床检查。