新生儿足底筛查的项目主要有新生儿先天性的甲状旁腺功能低下症、苯丙酮尿症和新生儿先天性的肾上腺皮质增生症，这三种疾病在新生儿期如果早期筛查之后并确诊，早期给予干预治疗都不会影响新生儿期后的神经和体格发育。
尤其是新生儿先天性的甲状腺功能低下症，如果早期没有发现，生后3个月才开始治疗，对新生儿的智能发育是有影响的，如果一岁之后才开始治疗，往往会影响新生儿的寿命，所以这几种常见疾病的筛查，都是目前在早期发现之后可以治疗的疾病，而且预后都是比较好的。