腰两侧隐隐作痛可以是以下几种原因引起：
第一、带状疱疹，严重带状疱疹的患者可以有双侧腰部的隐痛，也可以有刺痛，在潜伏期1-2周过后可以有成群的疱疹出现，这时要到皮肤科早期诊断和早期治疗。
第二、肾脏的疾病，当双侧的肾脏有炎症或者是结石、肿瘤时，在早期也可以有两侧腰部肾区的隐隐作痛，可以伴有轻微的血尿或蛋白尿，这时要检查肾脏的彩超、CT以及尿的化验来诊断和早期治疗。
第三、肾虚，当肾虚时也可以有腰两侧的隐痛，可以伴有膝软无力的症状，这时要到中医科把脉诊断，早期口服补肾药物治疗。