依诺肝素钠与低分子肝素钙都属于低分子肝素，但两者还是有区别的。首先在分子组成上肝素阴离子一个结合的是钠离子，另一个结合的是钙离子。低分子肝素钙比依诺肝素钠的安全性更好，副作用更少。
依诺肝素钠主要用于血液透析时预防血凝块的形成，也可以用于深静脉血栓的形成，而低分子肝素钙主要用于治疗和预防静脉血栓的形成，也可以用于血液透析时预防血凝块的形成。
依诺肝素钠的副作用比较多，最常见的副作用是血小板减少，会出现出血的风险，而低分子肝素钙的副作用比较少，出血的风险也比较少。